PubChem : base de données sur la chimie et la biologie

Ce n’est pas un moteur de recherche web, même si la page y ressemble. C’est un moteur de recherche dans une base de données publique, sur la chimie et la biologie.

pubchem.ncbi.nlm.nih.gov

C’est un site Américain soutenu par l’état (notez le “.gov” à la fin de l’URL).

Les recherches peuvent être faites sur un composé, une substance ou un résultat d’expérimentation en biologie.

Cliquez par exemple sur l’onglet “Compound” (normalement sélectionné par défaut) et soumettez une requête pour “ch4”. Le premier résultat est le méthane, présenté avec une vignette représentant la molécule de cet hydrocarbure (toute petite image, car cette molécule est simple). En suivant le lien, on trouve foule d’informations : structure 2D et 3D de la molécule, dénominations incluant les synonymes, les procédés de fabrication de ce composé, des liens vers les propriétés biologiques du composé.

C’est un site technique, non‑didactique.

PubChem est une base de données Américaine, surtout pour les molécules ayant une importance en biologie. Il existe une base de données Européenne ayant une fonction comparable, plus strictement validée, CheMBL. Il en existe d’autres encore pour les nucléotides des ADN.

• ChEMBL (ebi.ac.uk), la cousine Européenne de PubChem.
• GenBank (ncbi.nlm.nih.gov), une base de données du NCBI Américain, indiquant la protéine encodé par un nucléotide donné (pour les nucléotides publiquement connus).
• NCBI Databases (ncbi.nlm.nih.gov), d’autres bases de données du NCBI, qui en marge héberge aussi PubChem.
• chemspider.com, qui appartient à la Royal Society of Chemistry, elle est crowsourcée et par là moins strictement validée que PubChem ou ChEMBL, mais elle est plus généraliste.